Вот слайды с первой лекции по параллельному программированию с курсов, которые я сейчас прохожу, для того чтобы работать летом.
В целом, на первой лекции не было ничего интересного. Просто поглядите. И установите какой-нибудь c++ компилятор. Под виндой буду пользоваться Visual Studio 2008 (MSDNAAшная). Уже со второй лекции будут ДЗ (т.е. будем писать крутые проги).

PS: но это не та статья, про которую я говорил, когда речь была о биоинформатике.
PPS: вообще, в биоинформатике очень и очень много расчетов, и эти расчеты, как правило, однотипные. Поэтому там на каждом шагу применяется || программирование. Еще в комментах напишите, у кого видео карта CUDA поддерживает, и у кого НЕ многоядерные процы.